Paramilitärs und staatlich Einsatzkräfte sind laut Angaben von Forschungsinstitutionen für rund 80 Prozent aller Verbrechen im bewaffneten Konflikt schuldig. Santos ist zudem als Verteidigungsminister unter Ex-Präsident Álvaro Uribe für über 3.000 Morde an Zivilisten mitverantwortlich, die Soldaten anschließend als Rebellen präsentierten. In Kolumbien sind diese Fälle als „falsos positivos“ bekannt.