Thematisch soll sich die Edelweißpiraten-Stiftung insbesondere mit Datenschutz, Basisdemokratie, freiem Zugang zu Bildung, Bürgerrechten, Freiem Wissen, der Modernisierung des Urheberrechts, dem Leben im Informationszeitalter, dem Respekt vor der Privatsphäre der Menschen, und der Transparenz in Politik und Körperschaften widmen.