Nach seinem Mandatsverzicht nahm auch die Staatsanwaltschaft Wien zwei Verfahren gegen Pilz wieder auf. Dabei geht es um den Verdacht der „verbotenen Veröffentlichung“. Pilz soll Akten publik gemacht haben, mit denen er Amtsmissbrauch durch die Behörden argumentiert hat – in der Ekis-Affäre zur Jahrtausendwende, wonach FPÖ-Funktionäre illegal Daten aus dem Polizeisystem weitergegeben haben sollen.