Die IT-Agentur für Freiheit, Sicherheit und Recht wird zukünftig ihren Sitz in der estnischen Hauptstadt Tallinn haben und die digitale Verwaltung des Schengener Informationssystem II (SIS II), des Visa-Informationssystems (VIS) und der europäischen Speicherbank von Fingerabdrücken (EURODAC ) betreiben. Eine der vorrangigsten Aufgaben dieser IT-Agentur in Tallinn wird die weitere Entwicklung des Schengen-Informationssystem II (SIS II) sein, das eigentlich schon 2013 flächendeckend in allen Teilnehmer-Ländern einsetzbar sein sollte. Bei Testläufen des erweiterten Fahndungssystems haben sich jedoch in einigen Staaten Probleme gezeigt, die nicht innerhalb des geplanten Zeitraums zu beseitigen waren und deren Lösung demnächst in den umfassenden Aufgabenbereich der neuen europäischen IT-Agentur in Tallinn fallen wird.