Die Befehlskette der US-Streitkräfte verläuft administrativ vom Präsidenten über den Verteidigungsminister (National Command Authority) zu den Joint Chiefs of Staff (JCS). Die operative Befehlskette verläuft jedoch vom Präsidenten über den Verteidigungsminister direkt zu den Kommandeuren der einzelnen Unified Combatant Commands.

Der Vorsitzende der Joint Chiefs of Staff kann die Kommunikation zu den Kommandeuren der Unified Combatant Commands übernehmen, hat dabei jedoch keine operative Befehlsgewalt über die Truppen.

Die Teilstreitkräfte verfügen über parallele Kommandostrukturen, ihre jeweiligen Regionalkommandos sind in die zentralen UCCs integriert.