Die Argumente der Kriminalbeamten weisen allerdings auf die immer weiter verbesserten Verschlüsselungsalgorithmen der Nachrichtendienste wie WhatsApp oder Facebook-Messenger hin. Der Einsatz des Bundestrojaners sei in bestimmten Fällen unumgänglich. Für den Einsatz des Bundestrojaners auf Smartphones und Tablets sowie anderer, nicht weiter definierter „operativer IT-Systeme“ sollen weitere Kosten in Höhe von 50 Millionen Euro entstehen.